按照《云南省贯彻落实中央生态环境保护督察报告整改方案》要求，云南省林业和草原局牵头整改中央生态环境保护督察反馈问题共3项，分别是“云南省生物多样性受威胁，珍稀濒危物种保护任务重”（问题编号50-42）、“部分州市天然林保护修复任务艰巨”（问题编号50-43）、“高黎贡山国家级自然保护区仍需加强管理”（问题编号50-45）。
省林草局高度重视中央生态环境保护督察问题整改工作，坚决贯彻落实党中央、国务院和省委、省政府对中央生态环境保护督察工作的安排部署，扛好扛牢生态文明建设和生态环境保护政治责任，把整改任务分解落实到责任处室、分管领导，积极推进中央生态环境保护督察问题的整改落实，确保问题一项一项整改到位。
经调度统计，截至2021年11月底，省林草局牵头整改的3项中央生态环境保护督察反馈问题中，“部分州市天然林保护修复任务艰巨”问题已整改完成，问题整改涉及州市正在按程序组织开展县（市、区）自查自验、州（市）组织验收。另外2项“云南省生物多样性受威胁，珍稀濒危物种保护任务重”“高黎贡山国家级自然保护区仍需加强管理”问题整改已达到序时进度，正在积极推进问题整改中。