森林生态系统类型自然保护区 以森林植被及其生境所形成的自然生态系统作为主要保护对象的自然保护区。主要保护对象为典型和有代表性的森林、稀树草原群落及其生境形成的生态系统，包括生态系统或物种已遭破坏，而又有重要价值、有待恢复的地区，以及主要发挥水源涵养、水土保持等生态公益效益的森林。
自1958年建立自然保护区以来，至2012年末，云南省共建有森林生态系统类型自然保护区92处，面积213.11万公顷，分别占全省自然保护区总数的58.8%和总面积的75.8%。其中国家级13处，省级21处，州（市）级32处，县级26处。这些保护区的特点：①云南森林生态系统的典型代表，包括热带雨林、热带季雨林、季风常绿阔叶林、中山湿性常绿阔叶林、寒温性针叶林、暖性针叶林等森林生态系统类型，具有重大的科研价值和重要的保护意义。②保护着绝大部分的国家重点保护的动植物物种，如亚洲象、印支虎、滇金丝猴、羚牛、白颊长臂猿等4种长臂猿，黑颈鹤等多种鹤类，灰叶猴、马来熊等野生动物；望天树等多种龙脑香科树种、鹿角蕨、华盖木、四数木、野生稻、长蕊木兰、红豆杉、野生天麻、野生古茶树群落、龙血树、以及多种兰科和苏铁科等野生植物。③面积相对较大。