保护自然生态系统，就是保护生态文明的本源基础。2014年，广南县林业局做好"五件事"促进生物多样性保护，取得新进展。
一是对九龙山实行自然资源保护。县人民政府发布了九龙山范围内自然资源实行特别管护通告，启动者兔九龙山自然资源生物多样性保护行动。组建20人专业护林队，制订《全民保护九龙山公约》，2014年通过财政转移支付项目，在九龙山生态功能区造林绿化3000亩，今后将持续不断地对九龙山进行还山丰林，计划对九龙山森林资源总体普查并存档，同时对相关名贵树种挂牌标名保护。
二是开展极小种群救护与繁育工作。成功举办国家珍稀濒危植物蒜头果保护与发展研讨会议；开展蒜头果资源调查、优良品种选育、苗木繁育及示范基地建设工作；突破了蒜头果嫁接技术，人工繁育蒜头果实生苗10万株；以坝美、者兔为中心对全县桫椤的地域分布、科、属、种、生长现状进行调查建档，极小种群资源得到有效保护。
三是建立极小种群保护小区。为避免蒜头果不再遭受破坏，在曙光乡拖董村委会建立蒜头果保护小区300亩，通过建立保护小区，对蒜头果进行遗传多样性保护；同时，为开发利用保存好种质资源，在董堡乡完成500亩蒜头果基地建设。
四是启动地理标志产品保护申报工作。启动了广南蒜头果、广南油茶地理标志产品保护申报工作，目前已获云南省质量技术监督局批复并按程序申报审批。
五是兑现野生动物肇事补偿金。随着生态环境的不断改善和对野生动物保护力度的加强，野猪、猕猴等野生动物在该县逐渐繁衍起来，危害农作物事件不断发生。为了减少群众损失，林业局积极做好野生动物肇事补偿工作。2013年度共发放野生动物肇事补偿金27万元，涉及南屏、董堡、板蚌、莲城、杨柳井、者太、者兔7个乡镇339户，野生动物肇事补偿实现全覆盖。