按照《玉溪市林业生态红线划定原则方案》，玉溪市将国家级自然保护区纳入第一批林业生态保护红线划定范围，生态保护红线划定面积36653.9公顷，占国土面积的2.45%。管控级别划分一级管控区面积25264.3公顷，占红线面积的68.93%；二级管控区面积11389.6公顷，占红线面积的31.07%。其中哀牢山国家级自然保护区（新平县部分）红线面积为14275公顷，一级管控区面积10667公顷，二级管控区面积3608公顷。元江国家级自然保护区红线面积为22378.9公顷，一级管控区面积14597.3公顷，二级管控区面积7781.6公顷。
划定玉溪市林业生态红线，是认真贯彻落实党的十八届五中全会关于绿色发展理念的重要体现，对落实市委确定的"生态立市"战略，推动玉溪市在全省生态文明建设中走在前列具有十分重要的意义。玉溪市林业局高度重视林业生态保护红线划定工作，局党组专门召开会议进行研究部署，成立了以市林业局资武局长为组长的领导小组，研究制定了《玉溪市林业生态保护红线划定工作方案》。并委托第三方机构省林业规划设计院昆明分院通过考察研究、征求意见、专家论证和政府研究等环节，制定了《玉溪市林业生态保护红线划定原则方案》和《玉溪市生态保护红线监督管理办法》，根据《原则方案》，玉溪市林地红线保有量不低于98.13万公顷；森林红线保有量不低于84.85万公顷，森林蓄积量不低于5500万立方米；湿地红线面积不低于总面积4.31万公顷；公益林红线面积保有量不低于56.24万公顷；物种红线不少于现有保护野生动植物的种类和数量。在第一批林业生态保护红线划定的基础上，下一步将对全市剩余林业生态保护红线范围进行划定，并落实到山头地块，形成林业生态保护红线一张图管理。