为进一步强化对重大林业有害生物防控的组织领导，玉溪市人民政府印发《关于成立玉溪市重大林业有害生物防控指挥部的通知》，成立了由分管副市长为指挥长，市政府副秘书长、市林业局局长为副指挥长，市发改委、市公安局、市财政局、市商务局、市科技局、市农业局、市林业局等22家单位为成员的玉溪市重大林业有害生物防控指挥部。
指挥部下设办公室和专家组。办公室设在市林业局，办公室主任由市林业局分管副局长兼任，负责重大林业有害生物灾害应急处理的日常工作。专家组由市科技局、市农科院、市植保站、市农职院、市林业有害生物防治检疫局等单位的专家、教授组成，专家组组长、副组长分别由市林业局总工程师、正高级工程师担任，负责重大林业有害生物灾害的调查、评估和分析，提供技术咨询，并提出应对措施、建议及意见，开展相关科学研究。
指挥部的成立，体现了玉溪市委、市政府对重大林业有害生物防控工作的高度重视，为全面推进玉溪市重大林业有害生物防控工作，保护全市森林资源和生态文明建设奠定了坚实的基础。