“十三五”期间玉溪市累计完成有害生物防治面积281.92万亩。2020年全市林业有害生物发生面积47.35万亩(其中轻度36.89万亩、中度7.56万亩、重度2.9万亩)，在47.35万亩的林业有害生物发生面积中，病害发生面积为8.36万亩;虫害发生面积为38.86万亩;鼠害0.13万亩。防治面积46.17万亩，防治率97.5%，其中防治作业面积47.11万亩，无公害防治作业面积46.03万亩，无公害防治率97.7%，成灾面积1.456万亩，成灾率1.14‰，全年预测发生面积48.79万亩，实际发生面积47.35万亩，测报准确率97%;种苗产地检疫率100%;主要林业有害生物常发区监测覆盖率100%。无松材线虫病和无特别重大、重大突发公共事件发生。
“十三五”期间，玉溪市林业有害生物防控体系建设进一步完善。完成了通海县、新平县、江川区国家级中心测报点能力提升建设项目;设立了澄江、易门、元江三个市级中心测报点;实施了12个中央防治补助项目，涉及澄江市、通海县、新平县、元江县、易门县等;全面完成玉溪市全国第三次林业有害生物普查工作，获得了全省交叉检查验收第一名的好成绩;全市共设置踏查线路1130条，标准地3915个，踏查面积1125万亩;调查木材加工交易场所176个，苗圃(花圃)322个，种实、果品、花卉储藏加工交易场所9个;采集标本4300份，制作标本2068套，拍摄林业有害生物影像资料8144张。